部属事业单位

中国国际可持续交通创新和知识中心

交通运输部机关服务中心

交通运输部救助打捞局

中国船级社

交通运输部规划研究院

交通运输部科学研究院

交通运输部水运科学研究所（院）

交通运输部公路科学研究所（院）

交通运输部天津水运工程科学研究所（院）

大连海事大学

交通运输部管理干部学院

中国交通通信信息中心

交通运输部职业资格中心(交通运输部职业技能鉴定指导中心)

交通运输部路网监测与应急处置中心