为提高行政效率，便于船舶运输企业或其船舶代理人申请办理《台湾海峡两岸间水路运输许可证》与《台湾海峡两岸间船舶营运证》，我部决定自2014年1月1日起，实行网上受理行政许可申请。
　　一、网上行政许可的范围
　　网上行政许可适用于台湾海峡两岸间海上运输业务许可。
　　二、申请人资格主体及身份确认
　　为保证申请人网上提交申请材料的真实性、可靠性、安全性，根据有关法律法规的规定，经营两岸航运的船舶运输企业应事先申请取得“企业网上电子身份证书”（以下称“电子密钥”）。
　　三、网上办理程序
　　1、申请人事先申请取得“电子密钥”；
　　2、插入 “电子密钥” 登陆海峡两岸航运网上行政许可系统；
　　3、在网上填报申请并将申请材料扫描后即时传输,申请材料填报方法如下：
　　按照页面提示，如实、完整地填写申请表单；
　　依据附件所列证书名称一一对应上传附件；
　　浏览无误后确认、提交。
　　注意事项：
　　加盖印章、签名的及各种相关证书类的文件，申请人应当提交原件的电子扫描文档；
　　两页以上的文件合并为一个文件上传（比如：租船合同，扫描时，应当把这类两页以上文件的扫描方式设置为：“将多副图片存储成一个文件”）；
　　上传附件格式必须为WORD、TXT、WPS、PDF或JPG，单个文件大小不超过2MB；
　　所有材料需清晰、真实、有效。
　　4、有关交通运输主管部门依据《台湾海峡两岸间航运管理办法》（原交通部令1996年第6号）等有关规定进行审核、审批。网上许可事项的受理、审查、办结等情况在网上予以公布；
　　5、申请人在网上自行打印《台湾海峡两岸间水路运输许可证》与《台湾海峡两岸间船舶营运证》，并提交海事部门查验。
　　6、获准许可的航运公司和船舶名单在交通运输部网站公布，供有关管理部门和企业查询、验证。
　　四、注意事项
　　申请人在使用网上行政许可系统前应认真阅读本相关事项，并保证申请材料的真实、齐全、有效；发现有虚假内容的，将按有关规定严肃处理。使用过程中如有疑问，请通过下列电话咨询：（010）65293233 （水运局）